Procedente de una familia de músicos, Marcos Zuñiga ha estado inmerso en la música desde su más temprana edad.

Guitarrista profesional, descubre el mundo de la ópera durante sus estudios. El canto se convierte así en su nueva pasión. Como músico autor-compositor, crea varios espectáculos: Guitarra y Danza, El Llanto de la Guitarra, Zarzuela, donde se entrelazan diferentes artes como la danza, el canto, el instrumento, el teatro, abarcando desde la música clásica hasta influencias del flamenco.

Desde 2007, se presenta en varias casas de ópera, especialmente en la Ópera de Fribourg, Ópera de Lausana, Ópera de Avenches y en el Festival de Verbier.

En diciembre de 2008, funda el Duo Papilio junto a la guitarrista Anna Slezakova. Ha cantado en numerosas escenas internacionales, como en Japón, Suiza, Francia, España, Italia y República Checa.

En julio de 2024, fue seleccionado para interpretar el papel titular de Vidal Hernando en la zarzuela "Luisa Fernanda" en Panticosa, España.

Tuvo la oportunidad de trabajar con cantantes de renombre internacional, conocidas especialmente en el mundo de la zarzuela, como Nancy Fabiola Herrera, Yolanda Auyanet y María Rodríguez.